12 січня 1955 року здійснив висадку перший загін будівельників та військових для початку будівництва полігону та поселення. Спочатку був побудований наметове містечко та розпочато розробку плану майбутнього полігону. 20 липня 1955 року розпочалося будівництво першого стартового майданчика.

Місто разом з космодромом та прилеглими землями Росія орендувала у Казахстану до 2050 року, щорічно виплачуючи близько 200 мільйонів доларів. Тому Байконур – Територія Росії.

Ще космодрому потрібна була залізниця та великі запаси води. Проте вирішальним чинником стала потреба ракети Р-7 у кількох пунктах радіоуправління з відривом 150–500 км від точки старту. Такий розкиданий комплекс виявилося зручно розмістити у казахстанській степу.