Восени 1841 року Митя Менделєєв вступив до Тобольської гімназії. У молодших та середніх класах навчався неважливо: особливо недолюблював латину, чистописання та Закон Божий. Згадуючи цей час, учений зазначав, що «з класу до класу його переводили тому, що був розвинений».

Наприкінці літа 1850 року, після вступних іспитів, Дмитро Менделєєв був зарахований на фізико-математичний факультет Головний педагогічний інститут. Головний педагогічний інститут практично був відділення Петербурзького університету і займав частину його будівлі.

У 1841-1849 pp. навчався у Тобольській гімназії. Вища освіта Менделєєв отримав на відділенні природничих наук фізико-математичного факультету Головного педагогічного інституту в Петербурзі, курс якого закінчив у 1855 р. із золотою медаллю.