Найбільша кількість марганцю міститься в цілісному зерні (зародки пшениці, овес та висівки), рисі та горіхах (фундук, мигдаль та горіхи пекан), шоколаді, чаї, мідіях, молюсках, бобових, фруктах, листових овочах (шпинат), насінні (льон, кунжут, гарбуз) , соняшник та кедрові горіхи) та спеціях (порошок чилі, гвоздика та шафран).

Марганець швидко залишає кров'яне русло, у тканинах присутній, головним чином, у мітохондріях клітин. У підвищених кількостях він знаходиться у печінці, трубчастих кістках, підшлунковій залозі, нирках. Виводиться марганець з калом, потім сечею. Середньодобова потреба в марганці людини становить 25-5 мг.

Марганець активно впливає на обмін білків, вуглеводів та жирів. Важливою також вважається його здатність посилювати дію інсуліну та підтримувати певний рівень холестерину у крові. В присутності марганцю організм повніше використовує жири, підвищується засвоюваність міді.