Надмірний туризм у Мачу-Пікчу спричинив погіршення природного середовища та руїн туристами та неповагу до священного міста. Наприклад, багато туристів спустошували руїни, забруднювали територію сміттям і досліджували території, які виходили за межі їхнього контролю.

Мачу-Пікчу вважається дуже безпечним місцем для відвідування, хоча з міркувань безпеки важливо пам’ятати про висотну хворобу та завжди бути обережним під час походів і мати належне спорядження, адже деякі з походів Стежкою інків пропонують круті схили та нерівну місцевість.

Мачу-Пікчу стикається з різними загрозами: надмірний туризм, який особливо важкий на крихкому місці; утворення твердих побутових відходів; нестійкі методи ведення сільського господарства; надмірне випасання худоби та лісові пожежі; загострення ерозії; зсуви; видобуток корисних копалин; та інтродукція екзотичних рослин.

З урбанізацією навколишньої території, включаючи поширення Куско, Мачу-Пікчу та інші руїни інків у цьому районі руйнуються постійним припливом відвідувачів. Кам'яні споруди та платформи, які пережили війни, землетруси та негоду погрожують екскурсанти.

У січні 2023 року шлях інків до Мачу-Пікчу закрився через політичні потрясіння, які сколихнули Перу після того, як президент Кастільо влаштував державний переворот. У 2017 році зсув каміння поблизу кемпінгу Pacaymayu Alto вбив одну людину та поранив ще двох.

Загалом у Перу будьте дуже обережні через загрозу насильницьких злочинів. Ми радимо: будьте дуже обережні в Перу в цілому через загрозу насильницьких злочинів. У деяких регіонах застосовуються вищі рівні.